Istraživački centri uz odsjeke obavljaju funkciju koordinacije znanstvenoistraživačkog rada, organiziraju tečajeve, znanstvene i stručne skupove te provode informacijsko-izdavačke aktivnosti.

Na Fakultetu političkih znanosti djeluju slijedeći centri:

 Centar za empirijska politološka istraživanja (CEPIS)

Centar za Europske studije (CES)

 Centar za istraživanje etičnosti, državljanstva i migracija (CEDIM)

 Centar za međunarodne i sigurnosne studije (CeMSS)

Centar za istraživanje medija i komunikacije (CIM)